Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSKSQ9UJT2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSKSQ9UJT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms