Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATPIF1Q9UII2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms