Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA3Q9UI47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA3Q9UI47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms