Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP25Q9UHP3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms