Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP2Q9UHC6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms