Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP4Q9UGJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP4Q9UGJ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP4Q9UGJ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms