Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTRF1LQ9UGC7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1LQ9UGC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms