Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms