Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK4Q9UBT3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms