Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC4Q9UBN4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC4Q9UBN4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms