Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP28Q9P2N2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP28Q9P2N2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms