Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDH10Q9P2E7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH10Q9P2E7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms