Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGFRNQ9P2B2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGFRNQ9P2B2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms