Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTN3Q9P232 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN3Q9P232 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms