Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN3Q9P1Z3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms