Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMG20BQ9P0W2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HMG20BQ9P0W2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms