Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXXC1Q9P0U4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXXC1Q9P0U4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXXC1Q9P0U4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms