Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C9orf78Q9NZ63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C9orf78Q9NZ63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C9orf78Q9NZ63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C9orf78Q9NZ63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms