Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA3Q9NZ52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA3Q9NZ52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA3Q9NZ52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms