Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC10Q9NYD6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC10Q9NYD6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms