Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ING3Q9NXR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms