Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF38Q9NXL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF38Q9NXL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF38Q9NXL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF38Q9NXL2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms