Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms