Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CWC25Q9NXE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CWC25Q9NXE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms