Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM28Q9NW13 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM28Q9NW13 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBM28Q9NW13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM28Q9NW13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM28Q9NW13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms