Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1BQ9NVP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASF1BQ9NVP2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms