Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HELLSQ9NRZ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HELLSQ9NRZ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HELLSQ9NRZ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms