Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK9Q9NPC2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms