Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSU72Q9NP77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms