Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB18Q9NP72 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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RAB18Q9NP72 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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