Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L4AQ9HCS5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L4AQ9HCS5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L4AQ9HCS5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms