Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms