Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UPF2Q9HAU5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF2Q9HAU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms