Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRABDQ9H4I3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRABDQ9H4I3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms