Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms