Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG10Q9H0Y0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG10Q9H0Y0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms