Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC8Q9H0W5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC8Q9H0W5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC8Q9H0W5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms