Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC113Q9H0I3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC113Q9H0I3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms