Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBPF3Q9H094 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF3Q9H094 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.8 ms