Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC27Q9C0I9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC27Q9C0I9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC27Q9C0I9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms