Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms