Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPL4Q9BYD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms