Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAPERQ9BY12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCAPERQ9BY12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms