Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRTQ9BXP5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRTQ9BXP5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms