Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms