Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS2Q9BXC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms