Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR18Q9BV38 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
WDR18Q9BV38 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR18Q9BV38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms