Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP3BQ9BS92 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms