Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms