Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.33e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 NDST2-203ENST00000398701 545 ntTSL 229■■■□□ 2.233e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 228.12■■■□□ 2.094e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CIC-203ENST00000571942 601 ntTSL 527.87■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 427.84■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TMEM145-202ENST00000595775 558 ntTSL 327.42■■□□□ 1.983e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.744e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 425.82■■□□□ 1.721e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-204ENST00000594965 762 ntTSL 325.6■■□□□ 1.693e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 425.49■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DHX32-203ENST00000415732 803 ntTSL 324.97■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 C17orf62-223ENST00000582438 809 ntTSL 324.95■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TBL3-203ENST00000564171 917 ntTSL 223.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 423.5■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FPGS-210ENST00000473536 347 ntTSL 323.31■■□□□ 1.321e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XRCC3-205ENST00000553807 568 ntTSL 223.22■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.294e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-205ENST00000582388 825 ntTSL 222.65■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF544-202ENST00000594303 539 ntTSL 422.45■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DGKE-206ENST00000576869 1105 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SHH-205ENST00000472308 504 ntTSL 1 (best)22.37■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KATNB1-204ENST00000563127 733 ntTSL 222.11■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.11e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GPR108-206ENST00000595108 831 ntTSL 221.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ABCA2-222ENST00000494046 1622 ntTSL 521.72■■□□□ 1.077e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MFHAS1-203ENST00000520715 444 ntTSL 321.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GPR108-217ENST00000601716 670 ntTSL 521.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIS18BP1-204ENST00000454990 2131 ntTSL 221.36■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 13e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MFHAS1-204ENST00000521881 577 ntTSL 321.17■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SZT2-212ENST00000638631 2574 ntTSL 521.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ANKRD37-203ENST00000507479 649 ntTSL 421.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SHH-202ENST00000430104 677 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SHH-204ENST00000441114 888 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SHH-203ENST00000435425 807 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SZT2-201ENST00000357658 1601 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-215ENST00000560089 2804 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 520.69■□□□□ 0.97e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XRCC3-217ENST00000556980 801 ntTSL 520.54■□□□□ 0.887e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 420.38■□□□□ 0.851e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 C17orf62-205ENST00000536759 2222 ntTSL 220.18■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PRPF31-209ENST00000498612 881 ntTSL 520.18■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAFF-208ENST00000624676 3284 nt20.15■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XRCC3-215ENST00000555964 562 ntTSL 420.08■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-205ENST00000595047 1382 ntTSL 519.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC115-203ENST00000442217 1847 ntTSL 219.85■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-202ENST00000440541 2493 ntTSL 219.68■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIS18BP1-208ENST00000494512 531 ntTSL 519.62■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-203ENST00000423131 950 ntTSL 519.56■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TNFRSF10A-203ENST00000524158 693 ntTSL 519.46■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XRCC3-204ENST00000553361 746 ntTSL 519.37■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XRCC3-218ENST00000557439 2599 ntTSL 519.27■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SIPA1L1-216ENST00000557151 744 ntTSL 319.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-203ENST00000558051 552 ntTSL 419.07■□□□□ 0.641e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ABCA2-216ENST00000476211 997 ntTSL 219.04■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-203ENST00000594213 1002 ntTSL 318.86■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ELMO3-204ENST00000571587 780 ntTSL 518.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KATNB1-203ENST00000562592 853 ntTSL 317.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ABCA2-204ENST00000398207 876 ntTSL 517.88■□□□□ 0.457e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SZT2-203ENST00000406439 2198 ntTSL 217.87■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SIPA1L3-207ENST00000596403 811 ntTSL 317.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TMEM145-204ENST00000601020 352 ntTSL 317.27■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-204ENST00000503231 450 ntTSL 417.23■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 30.2
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 4390.8 ms